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/ Over 1,000 Windows 95 Programs / Over 1000 Windows 95 Programs (Microforum) (Disc 2).iso / 0351 / mwt_abbr.dat < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1997-04-01  |  2.8 KB  |  63 lines
  1. ;                        Abbreviation File for MWTWIN program
  2. ;
  3. ; Comments may be added by preceding with a semicolon
  4. ; Two group headings must exist: [AMINO ACIDS] and [ABBREVIATIONS]
  5. ; Abbreviations may be added; simply type the abbreviation and molecular
  6. ;   formula under the appropriate column in either section
  7. ; Note:  Only the first letter of an abbreviation is allowed to be capitalized
  8. ; Note:  Elements MUST be properly capitalized; eg. na is incorrect, use Na
  9. ; Note:  Parentheses and dashes are NOT allowed; eg. CH3(CH2)2 is incorrect
  10. ;                                                    use C3H7 or CH3CH2CH2
  11. ; The abbreviations in the Amino Acid section are treated as extended level
  12. ;   abbreviations:  they are only recognized when extended abbreviations are on
  13. ; If this file becomes corrupted, the MWTWIN program will inform the user
  14. ;    and ignore incorrect lines
  15. ; If this file becomes deleted, the MWTWIN program will create a new file
  16. ;    with the default abbreviations
  17. ;
  18. ; Default Amino Acids are in their ionic form
  19. ; Amino Acid abbreviations may be up to 6 characters long
  20. ; It is strongly advised that longer abbreviations be placed first
  21. [AMINO ACIDS]
  22. Ala     C3H5NO        ; Alanine
  23. Arg     C6H12N4O      ; Arginine, (unprotonated NH2)
  24. Asn     C4H6N2O2      ; Asparagine
  25. Asp     C4H5NO3       ; Aspartic acid (undissociated COOH)
  26. Cys     C3H5NOS       ; Cysteine (no disulfide link)
  27. Gln     C5H8N2O2      ; Glutamine
  28. Glu     C5H7NO3       ; Glutamic acid (undissociated COOH)
  29. Gly     C2H3NO        ; Glycine
  30. His     C6H7N3O       ; Histidine (unprotonated NH)
  31. Hyp     C5H7NO2       ; Hydroxyproline
  32. Ile     C6H11NO       ; Isoleucine (same as Leucine)
  33. Leu     C6H11NO       ; Leucine (same as Isoleucine)
  34. Lys     C6H12N2O      ; Lysine (unprotonated NH2)
  35. Met     C5H9NOS       ; Methionine
  36. Phe     C9H9NO        ; Phenylalanine
  37. Pro     C5H7NO        ; Proline
  38. Ser     C3H5NO2       ; Serine
  39. Thr     C4H7NO2       ; Threonine
  40. Trp     C11H10N2O     ; Tryptophan
  41. Tyr     C9H9NO2       ; Tyrosine
  42. Val     C5H9NO        ; Valine
  43.  
  44. ; Normal abbreviations may be up to 6 characters long
  45. ; It is strongly advised that longer abbreviations be placed first
  46. [ABBREVIATIONS]
  47. Phen    C12H8N2       ; Phenanthroline
  48. Urea    CON2H4        ; Urea, H2NCONH2
  49. Bpy     C10H8N2       ; Bipyridine
  50. Oac     C2H3O2        ; Acetate
  51. Otf     CO3SF3        ; Triflate, OSO2CF3
  52. Tpp     C44H28N4      ; Tetraphenylporphyrin, (C4H2N(C6H5C)C4H2N(C6H5C))2, mw 612.733
  53. Bu      C4H9          ; Butyl
  54. En      C2H8N2        ; Ethylenediamine, H2NCH2CH2NH2
  55. Et      C2H5          ; Ethyl, CH3CH2
  56. Me      CH3           ; Methyl
  57. Ms      CH3SO2        ; Mesyl, CH3SOO
  58. Ox      C2O4          ; Oxalate
  59. Ph      C6H5          ; Phenyl
  60. Py      C5H5N         ; Pyridine
  61. Ts      C7H7SO2       ; Tosyl, CH3C6H4SOO
  62. D       H2            ; Deuterium
  63.